Selain mengandung banyak khasiat ternyata buah mengkudu memiliki efek samping, antara lain efek samping buah mengkudu yaitu: menyebabkan sakit perut, diare, pusing, dan sakit kepala. Agar terhindar dari efek samping berbahaya, Anda sebaiknya berhati-hati sebelum mengonsumsi obat-obatan herbal dan tidak mengonsumsi secara berlebihan terutama jika Anda memiliki kondisi berikut ini: Ibu hamil, karena berisiko menimbulkan gangguan pada tumbuh kembang janin Penderita hyperkalemia, Penderita penyakit ginjal, Orang dengan gangguan pada organ hati.